More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1069 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  100 
 
 		 542 aa  1109    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  69.8 
 
 		 543 aa  775    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  56.98 
 
 		 529 aa  653    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  67.82 
 
 		 547 aa  770    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  87.08 
 
 		 542 aa  973    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  58.81 
 
 		 555 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  77.49 
 
 		 542 aa  858    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  70.9 
 
 		 543 aa  778    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  76.75 
 
 		 542 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  67.64 
 
 		 547 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  94.65 
 
 		 542 aa  1032    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  92.44 
 
 		 555 aa  1016    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.04 
 
 		 551 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  87.45 
 
 		 542 aa  975    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  78.82 
 
 		 543 aa  875    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  75.28 
 
 		 542 aa  845    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  67.82 
 
 		 547 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  75.28 
 
 		 542 aa  843    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  55.9 
 
 		 548 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  58.12 
 
 		 543 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  77.12 
 
 		 542 aa  862    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  71.03 
 
 		 542 aa  785    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  94.1 
 
 		 542 aa  1028    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  75.28 
 
 		 557 aa  845    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  57.01 
 
 		 550 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  77.9 
 
 		 543 aa  864    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  71.88 
 
 		 543 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  68.01 
 
 		 547 aa  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  74.35 
 
 		 542 aa  838    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  77.9 
 
 		 543 aa  867    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  79.52 
 
 		 542 aa  875    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  71.51 
 
 		 544 aa  791    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  78.27 
 
 		 543 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  72.55 
 
 		 550 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  78.45 
 
 		 545 aa  867    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  78.41 
 
 		 542 aa  874    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  69.1 
 
 		 547 aa  780    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  70.53 
 
 		 543 aa  789    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  58.55 
 
 		 553 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  86.53 
 
 		 545 aa  983    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  67.82 
 
 		 547 aa  764    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  88.19 
 
 		 542 aa  979    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  59.48 
 
 		 540 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  71.22 
 
 		 542 aa  816    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  79.11 
 
 		 542 aa  886    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  77.9 
 
 		 543 aa  869    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  78.27 
 
 		 543 aa  868    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  62.48 
 
 		 547 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3711  CTP synthetase  65.15 
 
 		 547 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.744386  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  76.2 
 
 		 542 aa  856    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.43 
 
 		 547 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  58.89 
 
 		 547 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.62 
 
 		 534 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  58.12 
 
 		 542 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  58.89 
 
 		 549 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  59 
 
 		 546 aa  628  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  57.54 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.12 
 
 		 558 aa  629  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  58.55 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.99 
 
 		 538 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.45 
 
 		 557 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.59 
 
 		 536 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  55.58 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  59 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  58.09 
 
 		 546 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  58.36 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  58.38 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  57.99 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  59 
 
 		 546 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000244608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  60.04 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.22 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  55.9 
 
 		 546 aa  618  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  57.01 
 
 		 543 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  59.4 
 
 		 545 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  58.1 
 
 		 550 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.22 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  59.22 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  59.14 
 
 		 545 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  57.22 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  57.43 
 
 		 555 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  58.96 
 
 		 546 aa  618  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  59.11 
 
 		 545 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  57.35 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0114  CTP synthetase  55.1 
 
 		 538 aa  617  1e-175  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.462919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.04 
 
 		 542 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0171  CTP synthetase  54.36 
 
 		 532 aa  615  1e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  57.88 
 
 		 543 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.59 
 
 		 547 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  59.03 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  59.03 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.22 
 
 		 543 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  56.93 
 
 		 552 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  59.03 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  55.88 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  55.92 
 
 		 559 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.75 
 
 		 543 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  58.66 
 
 		 545 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  58.99 
 
 		 545 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  56.75 
 
 		 542 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  55.64 
 
 		 545 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>