More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0966 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.45 
 
 
208 aa  213  2e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.45 
 
 
208 aa  213  2e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  57.53 
 
 
201 aa  211  6e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  57.53 
 
 
201 aa  211  6e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.31 
 
 
202 aa  211  6e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.38 
 
 
203 aa  211  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.85 
 
 
203 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.85 
 
 
203 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  55.08 
 
 
208 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  57.22 
 
 
201 aa  207  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.77 
 
 
204 aa  205  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50 
 
 
214 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50 
 
 
214 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  53.01 
 
 
206 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49 
 
 
232 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49 
 
 
232 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  57.07 
 
 
201 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.85 
 
 
202 aa  199  2e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.3 
 
 
217 aa  196  2e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.26 
 
 
201 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.8 
 
 
203 aa  195  4e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  55.43 
 
 
202 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.8 
 
 
207 aa  194  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 
232 aa  194  8e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.46 
 
 
216 aa  194  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.08 
 
 
216 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.76 
 
 
202 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.25 
 
 
213 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.54 
 
 
216 aa  191  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 
207 aa  191  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.76 
 
 
212 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.23 
 
 
205 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.12 
 
 
195 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.6 
 
 
182 aa  189  3e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  50.27 
 
 
203 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  48.26 
 
 
203 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  50 
 
 
203 aa  188  6e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  50 
 
 
203 aa  188  6e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  49.46 
 
 
203 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.23 
 
 
204 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.63 
 
 
215 aa  183  1e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.81 
 
 
198 aa  181  5e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.81 
 
 
198 aa  181  5e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  52.17 
 
 
202 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.73 
 
 
201 aa  179  3e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  45.69 
 
 
202 aa  178  6e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.73 
 
 
209 aa  177  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  50 
 
 
202 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.29 
 
 
206 aa  173  1e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.39 
 
 
198 aa  173  2e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.78 
 
 
211 aa  172  3e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 
207 aa  172  4e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
207 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  45 
 
 
199 aa  162  4e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41 
 
 
207 aa  161  8e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  2.37921e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.28 
 
 
199 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.63 
 
 
197 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  43.37 
 
 
194 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.5 
 
 
199 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  41.33 
 
 
213 aa  154  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 
199 aa  150  9e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.26863e-05  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  42 
 
 
213 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  42 
 
 
213 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.71 
 
 
199 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 
199 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.2 
 
 
204 aa  147  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 
204 aa  147  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 
199 aa  147  1e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.9 
 
 
209 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.63 
 
 
198 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.63 
 
 
198 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.63 
 
 
198 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.63 
 
 
198 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  39.49 
 
 
197 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
198 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  40.82 
 
 
201 aa  141  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  39.2 
 
 
201 aa  141  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.58 
 
 
198 aa  140  1e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 
199 aa  140  2e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 
198 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  39.7 
 
 
201 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.48 
 
 
198 aa  139  4e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  39.7 
 
 
201 aa  139  4e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.05 
 
 
198 aa  137  8e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
204 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  37.56 
 
 
197 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.8989e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.88 
 
 
232 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
200 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
204 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.39 
 
 
237 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.39 
 
 
198 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.39 
 
 
237 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.39 
 
 
237 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  38.69 
 
 
201 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.39 
 
 
237 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.39 
 
 
198 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.39 
 
 
237 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.85 
 
 
203 aa  135  3e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  39.7 
 
 
198 aa  135  6e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>