More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0925 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  253  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  98.37 
 
 		 123 aa  250  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  98.37 
 
 		 123 aa  250  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  95.93 
 
 		 123 aa  246  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  90.24 
 
 		 123 aa  233  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  88.62 
 
 		 123 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  86.99 
 
 		 134 aa  224  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  86.99 
 
 		 123 aa  224  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  81.15 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  81.15 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 123 aa  204  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  77.87 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  77.87 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  78.33 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 144 aa  200  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 127 aa  199  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  72.95 
 
 		 123 aa  196  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  76.86 
 
 		 121 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  74.38 
 
 		 121 aa  193  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  74.38 
 
 		 121 aa  193  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  73.55 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  75.21 
 
 		 121 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  72.73 
 
 		 121 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  74.38 
 
 		 121 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  73.33 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  69.17 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 		 1274 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  46.15 
 
 		 129 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  47.15 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1352 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1271 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1044 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1977 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  37.29 
 
 		 742 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 119 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 397 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1070 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 497 aa  94.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 929 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.75 
 
 		 1233 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1397 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1245 aa  90.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.43 
 
 		 1574 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  37.82 
 
 		 248 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1160 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1096 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1234 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1050 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35 
 
 		 236 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.36 
 
 		 763 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 948 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 1771 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1007 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.97 
 
 		 1060 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  34.71 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 234 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  37.82 
 
 		 1765 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 869 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  41.18 
 
 		 1361 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1333 aa  87.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1172 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.07 
 
 		 930 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  36.21 
 
 		 1188 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.07 
 
 		 921 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  35 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.07 
 
 		 942 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>