41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0885 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1578    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.12 
 
 		 4687 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  37.43 
 
 		 2113 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.07 
 
 		 1544 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  38.12 
 
 		 2682 aa  97.4  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  35.98 
 
 		 940 aa  91.7  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 1789 aa  91.3  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  36.6 
 
 		 2767 aa  81.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  34.43 
 
 		 1814 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 2107 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  32.62 
 
 		 1809 aa  75.1  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.42 
 
 		 1499 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.84 
 
 		 1607 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  31.46 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  32.37 
 
 		 959 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  32.95 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  32.62 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.4 
 
 		 4798 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  27.32 
 
 		 618 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1798 aa  67.4  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621176 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  29.78 
 
 		 844 aa  67  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 1925 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  32.03 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.45 
 
 		 3598 aa  65.1  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  31.69 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.67 
 
 		 1480 aa  63.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  31.47 
 
 		 1112 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  38.66 
 
 		 2296 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.15 
 
 		 999 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  27.93 
 
 		 928 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  44.78 
 
 		 2911 aa  58.9  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  30.4 
 
 		 466 aa  55.5  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.43 
 
 		 3209 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3589  hypothetical protein  23.39 
 
 		 943 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00513024  normal  0.358288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1306 aa  52  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  30.26 
 
 		 960 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  27.72 
 
 		 326 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  30.67 
 
 		 1805 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.29 
 
 		 2731 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  27.45 
 
 		 337 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>