More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0861 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 155 aa  310  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  86.45 
 
 		 155 aa  278  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  85.16 
 
 		 155 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  84.52 
 
 		 155 aa  270  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  81.01 
 
 		 158 aa  258  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  80.38 
 
 		 158 aa  257  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  80.38 
 
 		 158 aa  257  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  75 
 
 		 160 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  75.48 
 
 		 161 aa  250  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  76.13 
 
 		 158 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  75.48 
 
 		 160 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  75.48 
 
 		 158 aa  233  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  73.25 
 
 		 161 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  75.48 
 
 		 158 aa  231  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  74.84 
 
 		 158 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  70.97 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  74.84 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  70.97 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  71.43 
 
 		 161 aa  228  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  70.99 
 
 		 162 aa  227  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  70.37 
 
 		 162 aa  226  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  70.32 
 
 		 161 aa  224  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  73.05 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  70.62 
 
 		 160 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  70.62 
 
 		 160 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  71.25 
 
 		 160 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  66.67 
 
 		 162 aa  220  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  71.7 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  71.07 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  70.39 
 
 		 157 aa  217  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  76.55 
 
 		 165 aa  216  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 		 166 aa  214  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  71.43 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  68.12 
 
 		 164 aa  207  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  69.68 
 
 		 164 aa  206  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  67.74 
 
 		 161 aa  206  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  73.03 
 
 		 159 aa  206  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  66.24 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  64.52 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  69.29 
 
 		 188 aa  204  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  61.82 
 
 		 165 aa  196  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  59.85 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  60.47 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  57.66 
 
 		 152 aa  159  9e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  56 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 264 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  51.94 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1668  ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000154129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  51.94 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  47.53 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>