More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0802 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 595 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 609 aa  789    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 604 aa  740    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  67.11 
 
 		 607 aa  852    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  71.6 
 
 		 591 aa  892    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  84.18 
 
 		 595 aa  1063    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  84.01 
 
 		 595 aa  1060    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 		 623 aa  900    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 625 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 604 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  73.3 
 
 		 590 aa  907    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 599 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 591 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  87.75 
 
 		 596 aa  1102    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 597 aa  788    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 606 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 591 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 		 590 aa  900    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  69.46 
 
 		 593 aa  859    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 591 aa  796    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 		 590 aa  903    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 595 aa  1228    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  73.99 
 
 		 596 aa  953    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  72.11 
 
 		 590 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 		 590 aa  902    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 604 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 591 aa  802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 594 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 619 aa  752    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  80.78 
 
 		 594 aa  1012    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 590 aa  801    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  88.42 
 
 		 596 aa  1109    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  73.3 
 
 		 590 aa  909    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  64.05 
 
 		 605 aa  816    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 623 aa  711    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 614 aa  740    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  84.01 
 
 		 595 aa  1060    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  61.51 
 
 		 593 aa  755    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 604 aa  742    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 591 aa  783    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  83.69 
 
 		 601 aa  1056    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 590 aa  633  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 590 aa  626  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 605 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 604 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 605 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 601 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 606 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 588 aa  584  1.0000000000000001e-165  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 581 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 597 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 603 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 591 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 591 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 591 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 588 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 614 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 591 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 591 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 594 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 600 aa  495  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 593 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 627 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 590 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 598 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 626 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 594 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 599 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 589 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 598 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 595 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 594 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 619 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 594 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 585 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 602 aa  479  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 594 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 597 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 598 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 592 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 598 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 593 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 591 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 598 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 598 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 586 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 594 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>