298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0795 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  63.93 
 
 		 735 aa  909    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  56.16 
 
 		 728 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  65.92 
 
 		 731 aa  960    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  87.48 
 
 		 753 aa  1293    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  56.21 
 
 		 729 aa  755    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  59.05 
 
 		 721 aa  793    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  65.22 
 
 		 749 aa  931    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  76.6 
 
 		 746 aa  1120    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  86.63 
 
 		 734 aa  1303    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  65.83 
 
 		 801 aa  945    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  75.25 
 
 		 764 aa  1108    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  86.97 
 
 		 734 aa  1302    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  64.85 
 
 		 733 aa  943    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  66.14 
 
 		 736 aa  949    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  66.24 
 
 		 750 aa  929    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  56.16 
 
 		 728 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  63.61 
 
 		 790 aa  917    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  64.58 
 
 		 788 aa  923    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  64.3 
 
 		 788 aa  932    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  60.23 
 
 		 764 aa  828    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  64.3 
 
 		 788 aa  932    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  59.17 
 
 		 754 aa  813    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  66.67 
 
 		 733 aa  946    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  55.45 
 
 		 724 aa  773    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  66.14 
 
 		 736 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  64.79 
 
 		 759 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  65.96 
 
 		 741 aa  948    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  100 
 
 		 736 aa  1507    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  56.69 
 
 		 724 aa  772    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  58.49 
 
 		 722 aa  797    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  73.86 
 
 		 754 aa  1095    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  65.88 
 
 		 726 aa  982    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  58.23 
 
 		 724 aa  848    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  76.06 
 
 		 746 aa  1119    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  55.43 
 
 		 721 aa  744    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  62.66 
 
 		 736 aa  899    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  65.72 
 
 		 813 aa  937    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  56.96 
 
 		 727 aa  785    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  58.71 
 
 		 742 aa  821    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  47.35 
 
 		 765 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  46.49 
 
 		 707 aa  598  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  46.51 
 
 		 749 aa  595  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  44.26 
 
 		 713 aa  594  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  45.83 
 
 		 722 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  46.24 
 
 		 707 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  45.83 
 
 		 722 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  45.93 
 
 		 695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  46.99 
 
 		 766 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  44.95 
 
 		 713 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  47.04 
 
 		 721 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  45.45 
 
 		 720 aa  584  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  45.71 
 
 		 709 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  46.05 
 
 		 700 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  45.77 
 
 		 762 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  45.42 
 
 		 702 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.38 
 
 		 721 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  45.47 
 
 		 749 aa  582  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  45.32 
 
 		 708 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  44.51 
 
 		 745 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  44.99 
 
 		 731 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  45.96 
 
 		 744 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  44.17 
 
 		 709 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  45.69 
 
 		 745 aa  569  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  46.23 
 
 		 731 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  44.01 
 
 		 736 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  43.93 
 
 		 696 aa  572  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  46.79 
 
 		 691 aa  572  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  45.82 
 
 		 729 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  47.98 
 
 		 705 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  46.67 
 
 		 687 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  43.54 
 
 		 731 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  44.72 
 
 		 708 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  43.77 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.23 
 
 		 709 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.08 
 
 		 709 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.67 
 
 		 708 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  42.57 
 
 		 701 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  45.14 
 
 		 712 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  46.01 
 
 		 697 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  44.56 
 
 		 700 aa  553  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  45.72 
 
 		 702 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  43.97 
 
 		 770 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  46.37 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  44.11 
 
 		 743 aa  548  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.79 
 
 		 727 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  43.55 
 
 		 712 aa  548  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  41.68 
 
 		 692 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  44.35 
 
 		 714 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  44.67 
 
 		 882 aa  545  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  41.85 
 
 		 694 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  44.92 
 
 		 742 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  44.92 
 
 		 742 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  45.4 
 
 		 728 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  45.58 
 
 		 703 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  44.21 
 
 		 712 aa  545  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  44.92 
 
 		 742 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  46.25 
 
 		 763 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  42.17 
 
 		 720 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  46.39 
 
 		 730 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  43.37 
 
 		 743 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>