240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0719 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 313 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  72.64 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1178  RarD protein, DMT superfamily transporter  71.96 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  66.44 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  65.99 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  58.42 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4067  transporter DMT superfamily protein  65.07 
 
 		 299 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3340  RarD family protein  65.07 
 
 		 299 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3228  hypothetical protein  60.13 
 
 		 317 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  57.24 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0970  transporter DMT superfamily protein  57.57 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0101189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  54.03 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  54.74 
 
 		 290 aa  298  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  43.21 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  43.23 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  41.89 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  40.19 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  40.19 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  39.23 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  39.23 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  39.23 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  39.23 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  39.23 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.49 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  38.91 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.2 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  40.45 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.59 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  39.86 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  38.91 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  38.89 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.8 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.89 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  37.2 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.68 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.3 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  40.8 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  39.93 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  37.76 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  38.41 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.34 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  40 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1428  rarD protein  39.87 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.242387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.27 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  40.77 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.03 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.2 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  40.27 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  38.08 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  38.74 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  40.86 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.97 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.76 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  40.35 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  35.4 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  37.04 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  38.08 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.31 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  39.79 
 
 		 493 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.33 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.89 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  37.87 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  35.53 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  34.24 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  38.75 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  40.34 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  34.8 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  37.63 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  34.92 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  36.01 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  38.8 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  37.5 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  34.39 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  37.5 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  38.33 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  37.5 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  34.9 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  35.94 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  37.84 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.67 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  38 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  34.23 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  33.22 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  39.18 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  34.24 
 
 		 295 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  33.79 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  37.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  37.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.7 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  37.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  37.63 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  37.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  37.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  33.45 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  33.67 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  33.67 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.46 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.37 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.37 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>