More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0717 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  100 
 
 
320 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  84.06 
 
 
320 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  83.44 
 
 
320 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  74.21 
 
 
321 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  74.2 
 
 
320 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  73.89 
 
 
317 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  72.81 
 
 
321 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  73.48 
 
 
318 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  71.84 
 
 
317 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  71.84 
 
 
317 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  69.58 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  69.9 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  69.26 
 
 
326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  69.9 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  69.9 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  68.93 
 
 
310 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  69.26 
 
 
310 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  68.93 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  66.67 
 
 
320 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  67.96 
 
 
329 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  62.62 
 
 
316 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  62.62 
 
 
316 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  62.62 
 
 
316 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  62.86 
 
 
317 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  63.72 
 
 
318 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  66.34 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  66.34 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  65.4 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  65.71 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  66.34 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  66.02 
 
 
312 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  66.02 
 
 
312 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  66.02 
 
 
312 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  61.83 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  59.11 
 
 
313 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  58.15 
 
 
313 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  60.88 
 
 
321 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  58.15 
 
 
313 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  57.86 
 
 
319 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  59.29 
 
 
311 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  57.83 
 
 
326 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  56.87 
 
 
313 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  54.14 
 
 
323 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  54.43 
 
 
328 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  53.82 
 
 
323 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  53.82 
 
 
323 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  56.09 
 
 
316 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  53.5 
 
 
323 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  53.18 
 
 
323 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  53.18 
 
 
323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  56.47 
 
 
329 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  56.23 
 
 
316 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  52.23 
 
 
323 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  51.83 
 
 
330 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  55.95 
 
 
316 aa  348  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  52.23 
 
 
323 aa  348  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  50.32 
 
 
323 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  55.95 
 
 
342 aa  348  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  50.32 
 
 
323 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  52.22 
 
 
332 aa  342  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  54.66 
 
 
316 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  53.99 
 
 
316 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  51.59 
 
 
323 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  51.27 
 
 
321 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  46.79 
 
 
323 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  48.24 
 
 
326 aa  325  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
320 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  50.8 
 
 
333 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  51.13 
 
 
328 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  51.61 
 
 
321 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  51.94 
 
 
322 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  50.33 
 
 
316 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  51.29 
 
 
321 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
328 aa  312  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  47.1 
 
 
316 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  48.9 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  47.32 
 
 
322 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  47.1 
 
 
316 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  46.86 
 
 
320 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  44.12 
 
 
316 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  45.77 
 
 
324 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  44.3 
 
 
316 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  43.97 
 
 
316 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  44.44 
 
 
314 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  48.4 
 
 
315 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  43.81 
 
 
313 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  49.37 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  45.81 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  45.28 
 
 
319 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  42.68 
 
 
318 aa  278  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  46.47 
 
 
316 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  45.71 
 
 
326 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  43.44 
 
 
323 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  45.54 
 
 
318 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  45.43 
 
 
320 aa  275  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  41.8 
 
 
313 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  41.03 
 
 
315 aa  263  4e-69  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  37.9 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  40.71 
 
 
320 aa  261  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  37.9 
 
 
319 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>