More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0662 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  80.69 
 
 		 230 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.84 
 
 		 235 aa  367  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  71.98 
 
 		 236 aa  360  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  71.98 
 
 		 236 aa  358  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.41 
 
 		 236 aa  357  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.1 
 
 		 263 aa  334  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.49 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  63.76 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  64.35 
 
 		 233 aa  294  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  67.66 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.66 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  67.66 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  59.31 
 
 		 234 aa  288  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.14 
 
 		 231 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.93 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  62.77 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  61.47 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.64 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  57.63 
 
 		 239 aa  277  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.69 
 
 		 211 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  58.85 
 
 		 229 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.52 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.44 
 
 		 235 aa  274  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  59.39 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.26 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  58.41 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  58.7 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  58.41 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  56.9 
 
 		 232 aa  269  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  57.71 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  58.87 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.2 
 
 		 237 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  58.01 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  57.08 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  57.27 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  57.08 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  59.05 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.08 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  58.26 
 
 		 235 aa  264  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  57.08 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  56.19 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.19 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  57.08 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.64 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  57.08 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  55.65 
 
 		 234 aa  261  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  56.96 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.19 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  57.28 
 
 		 223 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.31 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  61.69 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  57.52 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  53.91 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.27 
 
 		 231 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  56.33 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  59.09 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  55.65 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  54.39 
 
 		 239 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  55.46 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  59.7 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.42 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.28 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  60.2 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  54.98 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.83 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  53.95 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.71 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  51.52 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4437  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.17 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3353  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.44 
 
 		 208 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  55.45 
 
 		 208 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  53.14 
 
 		 209 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  50.44 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.62 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  52.17 
 
 		 209 aa  224  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  49.57 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  50.72 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.21 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.19 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  50.72 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 		 215 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  52.48 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  51.98 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.72 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  48.88 
 
 		 228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1664  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.95 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  52.48 
 
 		 215 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  52.48 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.2 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  51.98 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>