More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0656 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 329 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  75.16 
 
 		 338 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  75.16 
 
 		 338 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  64.78 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  60.13 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  58.26 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  54.11 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  54.69 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  53.25 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  52.83 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.83 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  50.16 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  45.77 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  46.73 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  46.86 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  48.89 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  46.96 
 
 		 313 aa  291  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  48.23 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 		 314 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  46.73 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 		 342 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  48.89 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  49.05 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  48.67 
 
 		 343 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  46.62 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  45.19 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  46.37 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  48.01 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  48.08 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  45.02 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  45.05 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.73 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  48.42 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  48.72 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  47.78 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  45.86 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  48.1 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 		 310 aa  271  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  45.89 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  47 
 
 		 335 aa  268  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  45.74 
 
 		 329 aa  268  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  44.3 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  47.63 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  46.37 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  46.08 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  45.89 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  41.1 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  47.28 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 		 568 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  41.45 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  37.54 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  40.5 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  38.75 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  39.26 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  39.76 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.2 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  40.82 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  34.43 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  34.64 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  35 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  35.71 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.54 
 
 		 240 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.53 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.53 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.53 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.53 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.22 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 		 243 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 		 249 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.57 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.77 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.46 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  34.46 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.46 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>