More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0617 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  100 
 
 		 525 aa  1050    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.75 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  56.88 
 
 		 503 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  48.44 
 
 		 599 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 587 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  45.27 
 
 		 609 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  45.27 
 
 		 609 aa  276  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 646 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  45.53 
 
 		 648 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.94 
 
 		 627 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 614 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 		 607 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 612 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 610 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 583 aa  250  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 614 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 630 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 		 784 aa  238  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  48.8 
 
 		 783 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  48.8 
 
 		 783 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 774 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 484 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 		 717 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 770 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 911 aa  216  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 389 aa  216  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  42.28 
 
 		 773 aa  213  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 769 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 600 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  41.28 
 
 		 729 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 782 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 772 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.9 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  41.76 
 
 		 790 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 		 775 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 661 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 778 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  44.31 
 
 		 771 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 775 aa  206  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 769 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 		 523 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  43.92 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 769 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  44.58 
 
 		 513 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  44.58 
 
 		 513 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 798 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 764 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  43.14 
 
 		 774 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 786 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 844 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 763 aa  201  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 1046 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 646 aa  200  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 620 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  41.37 
 
 		 1353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 786 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 573 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 765 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  43.35 
 
 		 786 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 617 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  41.32 
 
 		 576 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 594 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.57 
 
 		 1352 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  39.58 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  43.15 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 505 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  37.42 
 
 		 697 aa  193  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 531 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 536 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 687 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 882 aa  190  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 779 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 536 aa  190  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  43.03 
 
 		 508 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1005 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  36.96 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 1118 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 530 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 1138 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  43.59 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 530 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 1276 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>