More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0520 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  77.96 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  76.64 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  70.65 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  68.01 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  63.49 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  64.09 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  60.76 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  60.4 
 
 		 318 aa  360  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  59.21 
 
 		 321 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  55.95 
 
 		 312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  59.09 
 
 		 316 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  56.66 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  56.66 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  56.66 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  54.66 
 
 		 313 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  56.31 
 
 		 353 aa  321  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  54.66 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  58.53 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  55.78 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  58.76 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  56.76 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  55.63 
 
 		 305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  58.8 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  56.99 
 
 		 308 aa  308  9e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  58.8 
 
 		 317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  57.49 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  54.11 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  58.76 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  54.25 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  56.01 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  55.52 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  52.56 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  52.56 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  54.24 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 		 295 aa  292  6e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  52.52 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  56.85 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  49.67 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  51.88 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  55.16 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  48.23 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  51.12 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.42 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.11 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 535 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  41.04 
 
 		 534 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  44.9 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  40.39 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 		 317 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  39.94 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.44 
 
 		 622 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 328 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  41.44 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  43.52 
 
 		 443 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  39.87 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  39.55 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 624 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  39 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  38.95 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  40.99 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  39.59 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  40.45 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  40.68 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>