120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0504 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  811    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  74.87 
 
 		 411 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  74.37 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  68.53 
 
 		 397 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  50.51 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  52.93 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  50.64 
 
 		 402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  53.94 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  53.94 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  49.24 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  37.73 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  35.07 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  34.01 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  34.1 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  34.01 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  34.24 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  33.75 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  33.78 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  35.35 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  32.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  32.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  32.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  32.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  32.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  32.36 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  32.36 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  33.25 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  32.12 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  32.12 
 
 		 410 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  33.08 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  33.58 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  36.15 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  32.99 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  32.99 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  32.99 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  33.92 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  33.92 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  32.93 
 
 		 423 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  35.24 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  34.01 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  34.01 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  34.01 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  32.74 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  34.21 
 
 		 444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  32.91 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  32.39 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  34.34 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  34.31 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  33.95 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  32.29 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  33.24 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  31.71 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  35.06 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  32.4 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  31.19 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  33.43 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  32.47 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  34.14 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  31.28 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  32.84 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  32.76 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  31.88 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  32.67 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  32.61 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  32.52 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  31.25 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  31.34 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  29.5 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  30.39 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  30.62 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  32.56 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  34.17 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  33.43 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  35.56 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  32.35 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2178  protein of unknown function DUF1006  33.7 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0894298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  31.08 
 
 		 398 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  30.96 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  31.13 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  30.48 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  32.75 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2383  hypothetical protein  31.46 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  30.88 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  31.54 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  29.88 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  29.59 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  30.92 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  31.09 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  31.41 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  29.47 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  31.2 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>