37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0465 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  56.97 
 
 		 644 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  57.26 
 
 		 644 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  100 
 
 		 644 aa  1291    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  33.22 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  34.63 
 
 		 639 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  33.77 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  27.01 
 
 		 633 aa  210  7e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  30.97 
 
 		 652 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  26.83 
 
 		 686 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  26.53 
 
 		 685 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  24.53 
 
 		 679 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  24.53 
 
 		 661 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  26.68 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  24.94 
 
 		 631 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  24.82 
 
 		 631 aa  110  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  27.53 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  25.44 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  25.37 
 
 		 631 aa  110  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0574  hypothetical protein  25.64 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19913  normal  0.950103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 631 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  28.7 
 
 		 527 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  31.09 
 
 		 586 aa  72  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  24.21 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  28.64 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  25.1 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  25.4 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0530  hypothetical protein  26.92 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252923  normal  0.408667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  27.16 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  26.71 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  26.71 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  21.5 
 
 		 676 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  22.08 
 
 		 649 aa  54.3  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  26.47 
 
 		 652 aa  51.2  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2685  hypothetical protein  24.39 
 
 		 607 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  41.51 
 
 		 239 aa  48.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0531  hypothetical protein  26.26 
 
 		 202 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2789  hypothetical protein  23.63 
 
 		 297 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00516287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>