219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0444 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  73.34 
 
 		 634 aa  926    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  57.35 
 
 		 656 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  75.16 
 
 		 632 aa  979    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  64.08 
 
 		 633 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  53.04 
 
 		 651 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  56.54 
 
 		 657 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  55.75 
 
 		 629 aa  648    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  56.01 
 
 		 672 aa  692    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  56.26 
 
 		 670 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  54.96 
 
 		 651 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  54.94 
 
 		 637 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  53.41 
 
 		 633 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  55.22 
 
 		 652 aa  683    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  53.48 
 
 		 630 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  54.23 
 
 		 634 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  55.77 
 
 		 666 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  54.13 
 
 		 633 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  56.42 
 
 		 668 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  54.71 
 
 		 637 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  54.55 
 
 		 636 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  54.57 
 
 		 633 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  56.42 
 
 		 668 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  53.91 
 
 		 634 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  56.51 
 
 		 643 aa  688    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  56.89 
 
 		 658 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  64.66 
 
 		 633 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  56.02 
 
 		 632 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  55.06 
 
 		 640 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  52.88 
 
 		 651 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  72.51 
 
 		 633 aa  892    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  70.1 
 
 		 633 aa  878    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  100 
 
 		 630 aa  1267    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  53.39 
 
 		 651 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  75.47 
 
 		 632 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  54.22 
 
 		 637 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  52.76 
 
 		 641 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  54.51 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  48.51 
 
 		 632 aa  595  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  50.87 
 
 		 648 aa  598  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  48.71 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  47.35 
 
 		 636 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  46.72 
 
 		 627 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  47.44 
 
 		 637 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  47.28 
 
 		 637 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  49.44 
 
 		 634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  46.4 
 
 		 628 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  47.28 
 
 		 653 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  48.14 
 
 		 626 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  46.74 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  45.91 
 
 		 622 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  46.58 
 
 		 688 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  46.79 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  46.58 
 
 		 638 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  47.11 
 
 		 630 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  47.11 
 
 		 630 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 622 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  46.58 
 
 		 638 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  46.79 
 
 		 628 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  45.99 
 
 		 621 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  44.48 
 
 		 626 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  46.89 
 
 		 624 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  47.11 
 
 		 660 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  46.93 
 
 		 656 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  47.17 
 
 		 647 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  46.31 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  46.35 
 
 		 639 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  46.36 
 
 		 631 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  45.98 
 
 		 628 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  46.78 
 
 		 660 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  45.76 
 
 		 622 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  45.5 
 
 		 664 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  46.95 
 
 		 628 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  45.44 
 
 		 625 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  45.19 
 
 		 620 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  45.03 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  45.59 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  45.59 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  45.89 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  44.94 
 
 		 620 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  45.31 
 
 		 628 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  45.35 
 
 		 622 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  46.86 
 
 		 641 aa  545  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  46.54 
 
 		 633 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  44.35 
 
 		 620 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  44.52 
 
 		 620 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  45.11 
 
 		 631 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  45.11 
 
 		 631 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  46.7 
 
 		 633 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 614 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  46.23 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  43.36 
 
 		 661 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  42.97 
 
 		 637 aa  538  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  43.75 
 
 		 622 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  44.55 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  46.39 
 
 		 639 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4015  K potassium transporter  47.24 
 
 		 632 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.035438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  44.32 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>