More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0326 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
353 aa  690    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  60.17 
 
 
349 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  35.69 
 
 
354 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 
341 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  36.61 
 
 
352 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  35.21 
 
 
347 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
347 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  34.22 
 
 
358 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  32.18 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 
364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.53 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  31.01 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  34.23 
 
 
343 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
367 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  31.89 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.97 
 
 
331 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  32.73 
 
 
327 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  27.94 
 
 
348 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  27.94 
 
 
348 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
348 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
333 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
377 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.23 
 
 
395 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 
374 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  30.07 
 
 
398 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  38.46 
 
 
264 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
268 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  38.96 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.68 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  36.36 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  29.97 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  31.34 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  35.95 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  37.09 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  36.69 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  38.96 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.52 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  38.96 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  39.31 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
496 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  34.97 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  35.66 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  37.93 
 
 
493 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
500 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  37.24 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 
503 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  36.99 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  35.91 
 
 
497 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  36.42 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.69 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  33.82 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.15 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  35.15 
 
 
533 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  35.8 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  27.86 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  34.73 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.19 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  36.9 
 
 
589 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  37.65 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  31.29 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  36.9 
 
 
572 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.9 
 
 
560 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  36.9 
 
 
589 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  36.9 
 
 
589 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  36.59 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  36.9 
 
 
572 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  33.68 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  36.9 
 
 
572 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  35.33 
 
 
564 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  36.9 
 
 
572 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  35.12 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.37 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  35.33 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.63 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  34.75 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  26.17 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 
564 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  34.03 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>