271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0166 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  72.03 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  67.83 
 
 
142 aa  190  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  71.33 
 
 
145 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  69.53 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  54.61 
 
 
141 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  55.71 
 
 
138 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  56.64 
 
 
137 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  55.63 
 
 
138 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  54.93 
 
 
138 aa  153  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  54.61 
 
 
140 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  54.23 
 
 
159 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  55.32 
 
 
139 aa  150  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  58.9 
 
 
151 aa  150  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  54.68 
 
 
138 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  55.71 
 
 
143 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  56.64 
 
 
146 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  56.64 
 
 
146 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  55.48 
 
 
137 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  58.27 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  57.64 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  60.71 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  52.11 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  57.24 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  56.38 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  51.41 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  51.41 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  54.29 
 
 
143 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  57.62 
 
 
143 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  57.62 
 
 
143 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  55.7 
 
 
143 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  56.95 
 
 
143 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  55.56 
 
 
145 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  60.42 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  53.52 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  57.34 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 
163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  51.41 
 
 
139 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  55.78 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  58.04 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  55.24 
 
 
143 aa  131  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  52.74 
 
 
142 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  54.86 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  52.05 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  51.02 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 
141 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  55.32 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  53.9 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  54.61 
 
 
140 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  52.11 
 
 
131 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  53.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  51.39 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  54.11 
 
 
148 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  49.66 
 
 
155 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 
140 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  54.17 
 
 
143 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  57.04 
 
 
142 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  57.04 
 
 
142 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  49.29 
 
 
132 aa  120  7e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  54.23 
 
 
143 aa  120  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  54.14 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 
142 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  50.71 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  53.38 
 
 
149 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  45.32 
 
 
133 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  52.42 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  49.6 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  48.97 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  48.28 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
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NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.242536 
 
 
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NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  51.61 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  48.94 
 
 
152 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  47.22 
 
 
136 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  52.68 
 
 
143 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
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NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  44.59 
 
 
142 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
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NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  47.22 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  54.46 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  48.25 
 
 
148 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  47.59 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  46.9 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  47.55 
 
 
137 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
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