70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0162 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  66.09 
 
 		 117 aa  159  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  66.96 
 
 		 117 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  67.86 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  65.49 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  64.6 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  63.39 
 
 		 116 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  64.29 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  65.14 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  66.36 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  64.29 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  66.97 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  66.36 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  60.18 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  60.36 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  56.88 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  58.04 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  56.25 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  59.26 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  54.05 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  55.36 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  55.05 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  52.25 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  51.35 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  55.56 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  55.56 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  53.7 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  48.11 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  52.73 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  55.56 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  52.88 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  53.7 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  48.35 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  45.65 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  46.91 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  40.22 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  37.23 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  32.41 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  29.73 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  29.13 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  27.52 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  36.27 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  30.61 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  38.54 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  29.36 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  30.21 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  34.86 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  27.78 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  26.61 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  43.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  43.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  43.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  27.72 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  38 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  26.73 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.78 
 
 		 323 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.55 
 
 		 323 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  34.38 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  34.82 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  33.33 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  34.19 
 
 		 374 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  31.78 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>