More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0161 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 362 aa  726    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.9 
 
 		 362 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.9 
 
 		 362 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  74.1 
 
 		 363 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.2 
 
 		 364 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.2 
 
 		 364 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.76 
 
 		 364 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.79 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.29 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  57.02 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  56.08 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.98 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.42 
 
 		 352 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.56 
 
 		 348 aa  328  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.56 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.09 
 
 		 354 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.09 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.23 
 
 		 359 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.7 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.85 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  57.06 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.32 
 
 		 357 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.58 
 
 		 358 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.3 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.74 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.57 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.85 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.44 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.57 
 
 		 358 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.41 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 		 356 aa  305  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  47.01 
 
 		 336 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.98 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.9 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.21 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.61 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.26 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.46 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.53 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.69 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.69 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.61 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.07 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.48 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.55 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.81 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 336 aa  285  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.91 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  46.29 
 
 		 384 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.6 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.9 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.27 
 
 		 343 aa  282  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 354 aa  281  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.41 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.31 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.38 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 339 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.88 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 340 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.71 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  48.62 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  44.67 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  44.44 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.97 
 
 		 343 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.71 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.88 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.13 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.05 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>