More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0148 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  82.12 
 
 
307 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  81.43 
 
 
307 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  78.18 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  68.44 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  68.56 
 
 
316 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  68.9 
 
 
316 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  69.77 
 
 
306 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  59.74 
 
 
306 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  61.39 
 
 
307 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  58.03 
 
 
308 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  58.25 
 
 
307 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  57.48 
 
 
308 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  57.7 
 
 
307 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  59.14 
 
 
306 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  58.8 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  56.19 
 
 
343 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  60.13 
 
 
330 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  58.44 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  59.8 
 
 
306 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  57.19 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  56.72 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  60.8 
 
 
307 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  57.81 
 
 
307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  58.14 
 
 
308 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  55.48 
 
 
307 aa  292  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  51.67 
 
 
315 aa  288  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  47.51 
 
 
305 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  52.32 
 
 
304 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  49.17 
 
 
304 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  47.6 
 
 
296 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  49.18 
 
 
307 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  49.5 
 
 
312 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  49.17 
 
 
307 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  44.75 
 
 
303 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  47 
 
 
301 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  34.87 
 
 
313 aa  177  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.99 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 
420 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  28.87 
 
 
427 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  28.93 
 
 
415 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  27.89 
 
 
426 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 
350 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 
415 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 
352 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  27.88 
 
 
415 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.74 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  28.72 
 
 
428 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  25.86 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  27.33 
 
 
417 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  28.62 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.93 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.64 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  27.46 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  35.07 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 
443 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  32.85 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.76 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  26.87 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  30.11 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  26.59 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.36 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.84 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.89 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.89 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  31.3 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.24 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  23.89 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  26.28 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  26.28 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.02 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.02 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.69 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.69 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.69 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.69 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  28.36 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.63 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  22.94 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.63 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  27.62 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  26.02 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  25.37 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.98 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  28.99 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  26.71 
 
 
260 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  27.94 
 
 
261 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  27.57 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  26.27 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  24.06 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>