231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0105 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  64.36 
 
 		 211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  60.59 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  59.7 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  51.49 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  50.99 
 
 		 232 aa  201  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  50.5 
 
 		 232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  54.41 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  54.41 
 
 		 198 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  51.96 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  48.72 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  45.54 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  50.5 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  44.78 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  42.86 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  42.21 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  39.32 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  39.69 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  43.86 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.93 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  44.51 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  42.02 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  39.22 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  41.14 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  41.67 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  39.15 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  39.58 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  42.49 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  37.93 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  38.25 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.86 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.37 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.23 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.23 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  37.5 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.5 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  38.05 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  37.44 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  39.44 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.45 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  37.44 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  37.56 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  35.98 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  35.98 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  35.98 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  35.98 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  35.98 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  36.04 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  38.02 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  35.61 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  37.04 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  36.17 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  36.51 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.53 
 
 		 234 aa  98.2  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  33 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  35.61 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  38.22 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  33.02 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  37.13 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.42 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  39.36 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 		 583 aa  90.9  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  29.11 
 
 		 240 aa  84.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  29.11 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.87 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  33.8 
 
 		 315 aa  72  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  30.54 
 
 		 312 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  30 
 
 		 318 aa  71.2  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  30 
 
 		 318 aa  71.2  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  31.41 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  29.31 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  33.8 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  32.57 
 
 		 330 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  28.03 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 313 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  29.01 
 
 		 336 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  31.45 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  29.7 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  26.52 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  27.65 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  27.65 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  27.65 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  30 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0183  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000066395  normal  0.0569679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  29.63 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 322 aa  65.1  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  28.81 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 322 aa  65.1  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>