167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0086 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 599 aa  1164    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  52.19 
 
 		 2157 aa  203  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  37.99 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  44.17 
 
 		 1259 aa  162  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  51.05 
 
 		 1235 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  41.09 
 
 		 2396 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  37.83 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  39.1 
 
 		 2095 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.82 
 
 		 1616 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.82 
 
 		 1616 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1616 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 816 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 831 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 831 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 816 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 816 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 816 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.24 
 
 		 820 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.42 
 
 		 1854 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  33.04 
 
 		 831 aa  97.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  30.42 
 
 		 3355 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.71 
 
 		 1588 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  35.27 
 
 		 827 aa  91.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.78 
 
 		 1674 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  30.71 
 
 		 1411 aa  91.7  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  31.9 
 
 		 1546 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.5 
 
 		 877 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  39.91 
 
 		 962 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.17 
 
 		 1012 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  33.75 
 
 		 1068 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  35.89 
 
 		 1405 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.52 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  37.24 
 
 		 1186 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  25.51 
 
 		 4238 aa  84.3  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.64 
 
 		 1549 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  28.96 
 
 		 1230 aa  82.8  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  32.47 
 
 		 279 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28.96 
 
 		 1516 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  25.9 
 
 		 1447 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  27.95 
 
 		 3554 aa  80.5  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  31.99 
 
 		 998 aa  80.5  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  29.05 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  25.9 
 
 		 1342 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  25.9 
 
 		 1447 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  26.63 
 
 		 1472 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  30.44 
 
 		 3192 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  36.57 
 
 		 548 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  36.86 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  28.86 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  32.88 
 
 		 1654 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  26.42 
 
 		 1446 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  36.61 
 
 		 1333 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  35.47 
 
 		 1487 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  31.18 
 
 		 600 aa  75.5  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  29.23 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  32.11 
 
 		 1471 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  29.12 
 
 		 2906 aa  73.9  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  32.11 
 
 		 1471 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1090 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1090 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1090 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1122 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  38.85 
 
 		 1613 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1122 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  29.28 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1122 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  39.26 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  29.81 
 
 		 2851 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  31.55 
 
 		 2832 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  25.62 
 
 		 3737 aa  71.2  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  34.43 
 
 		 2392 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  29.49 
 
 		 735 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  25.77 
 
 		 4526 aa  70.5  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  31.74 
 
 		 1669 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  34.48 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  31.74 
 
 		 1705 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.44 
 
 		 3635 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  31.49 
 
 		 1766 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  31.49 
 
 		 1535 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  27.78 
 
 		 5143 aa  67.4  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  32.33 
 
 		 2141 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  30.63 
 
 		 1713 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  29.13 
 
 		 3920 aa  65.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  42.72 
 
 		 1190 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  42.72 
 
 		 1440 aa  64.7  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  33.05 
 
 		 1353 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  26.9 
 
 		 1212 aa  64.7  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0011  putative outer membrane protein  34.64 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  33.46 
 
 		 898 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  31.49 
 
 		 1626 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  33.97 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  27.15 
 
 		 3078 aa  62.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  31.86 
 
 		 1814 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  33.46 
 
 		 2505 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  54.9 
 
 		 1204 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  54.9 
 
 		 1125 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  33.22 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  53.85 
 
 		 1197 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  32.19 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  53.85 
 
 		 1197 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>