46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0076 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  44.73 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  44.02 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  41.84 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  38.82 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  33.19 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  31.17 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  30.38 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  30.38 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  31.91 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  28.94 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  32.17 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  29.18 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  29.27 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  28.7 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  31.22 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  26.39 
 
 		 277 aa  62  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  29.55 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  25.41 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  28.63 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  32.88 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  28.76 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  31.95 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  25.42 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  30.93 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  30.43 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  28.27 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  30.6 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  28.82 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  30.71 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  29.31 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  38.33 
 
 		 696 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  29.6 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  23.81 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  29.83 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  31.42 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  29.83 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  23.31 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  37.31 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  28.63 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  26.07 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  29.46 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  41.86 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>