More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0064 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0064  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2879  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  63.21 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.571026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0321  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.57 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3354  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.11 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.0196184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3097  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.23 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653129  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0870  putative esterase protein  46.22 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3430  Alpha/beta hydrolase fold-3  46.35 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5138  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.13 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5482  lipase esterase  41.89 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000559952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2561  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.06 
 
 		 293 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1296  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.99 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.1 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1361  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.59 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4336  esterase/lipase/thioesterase  37.71 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4868  esterase/lipase/thioesterase  39.3 
 
 		 291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00085795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  36.93 
 
 		 311 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.36 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05501  lipase/esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01050)  34.68 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.737319  normal  0.319668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  38.89 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.93 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 		 628 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.98 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  40.4 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.05 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_003296  RS02619  lipase protein  40.61 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1791  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.5 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0512  putative carboxylesterase  39.39 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0826  putative carboxylesterase  39.39 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.06 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2143  putative carboxylesterase  39.39 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0415  putative carboxylesterase  39.39 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1467  putative carboxylesterase  39.39 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1839  lipase-like protein LlpE  39.39 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.65 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4336  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.09 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.38701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.26 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.09 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  33.05 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.53 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.11 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.11 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.7 
 
 		 306 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.68 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.71 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.78 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.73 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.92 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.53 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.89 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.24 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.02 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.02 
 
 		 339 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.92 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.56 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.26 
 
 		 328 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.84 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.63 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4633  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.27 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.416952  normal  0.230577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.3 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  31.44 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.59 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  30.84 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.14 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.94 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.77 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.69 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  33.63 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.9 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0848  putative carboxylesterase  30.38 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000392053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  30.7 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.56 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  30.23 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.36 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.02 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.56 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23980  esterase/lipase  32.65 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.8 
 
 		 301 aa  99.4  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  34.03 
 
 		 320 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3830  esterase/lipase/thioesterase  33.98 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.418878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4533  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.97 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.16 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.03 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.14 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.53 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.07 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.84 
 
 		 370 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  33.63 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.18 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.16 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.59 
 
 		 329 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09330  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.11 
 
 		 323 aa  95.5  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  29.44 
 
 		 338 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1004  heroin esterase  34.25 
 
 		 317 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.55 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.74 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>