More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0042 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  337  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  70.99 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  69.14 
 
 		 171 aa  221  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  65.48 
 
 		 167 aa  220  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  57.14 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  56.86 
 
 		 158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  56.86 
 
 		 158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  47.53 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  61.54 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  60.98 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  59.32 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  46.67 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  45.91 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  57.89 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  48.17 
 
 		 195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  52.03 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  44.25 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  53.51 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  45 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  42.5 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  45 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  49.06 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  48.75 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  55.93 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  43.48 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  52.5 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  51.24 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  44.05 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  40 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  43.45 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  51.97 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  43.45 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  47.79 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  44.1 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  37.65 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  48.09 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  41.61 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  37.65 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  49.57 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  41.21 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  50.44 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  40.37 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  44.85 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  43.03 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  52.1 
 
 		 200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  46.88 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  40 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  43.75 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  47.32 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  40.37 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  43.48 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  43.75 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  43.75 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  43.75 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  43.75 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  43.75 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  35.19 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  35.19 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  36.65 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  43.12 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  35.62 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  43.12 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  43.12 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  37.27 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  54.17 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  35.15 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  48.28 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  54.17 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  46.02 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  44.92 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  46.4 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  36.48 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  36.48 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  42.75 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  47.86 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  41.61 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  44.1 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  43.85 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  49.15 
 
 		 137 aa  101  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  44.1 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  40.51 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  47.06 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  47.06 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  41.25 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  43.48 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  42.75 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  43.56 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  42.33 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>