More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0029 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  46.34 
 
 		 759 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  46.54 
 
 		 759 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  50.67 
 
 		 752 aa  736    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  60.35 
 
 		 751 aa  914    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  85.28 
 
 		 761 aa  1318    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  45.68 
 
 		 761 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  49.12 
 
 		 749 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  74.37 
 
 		 763 aa  1133    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  46.81 
 
 		 759 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  45.81 
 
 		 759 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  46.75 
 
 		 764 aa  664    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  46.54 
 
 		 759 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  46.47 
 
 		 759 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  45.81 
 
 		 759 aa  651    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  48.85 
 
 		 749 aa  722    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  60.21 
 
 		 751 aa  933    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  47.21 
 
 		 759 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  46.68 
 
 		 759 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  47.73 
 
 		 750 aa  641    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  75.17 
 
 		 763 aa  1144    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  46.02 
 
 		 756 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  49.93 
 
 		 773 aa  700    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  50.34 
 
 		 752 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  47.27 
 
 		 754 aa  669    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  46.54 
 
 		 759 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  45.21 
 
 		 757 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  46.01 
 
 		 777 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  84.89 
 
 		 761 aa  1326    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  57.57 
 
 		 763 aa  881    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  46.81 
 
 		 759 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  45.67 
 
 		 759 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  45.25 
 
 		 773 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  50.6 
 
 		 752 aa  729    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  45.53 
 
 		 766 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  46.76 
 
 		 783 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  44.81 
 
 		 760 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  60.08 
 
 		 759 aa  932    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  46.81 
 
 		 759 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  45.94 
 
 		 756 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  48.39 
 
 		 771 aa  669    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  49.73 
 
 		 749 aa  703    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  48.39 
 
 		 752 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  50.87 
 
 		 779 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  46.07 
 
 		 756 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  46.81 
 
 		 759 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  48.72 
 
 		 758 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  65.05 
 
 		 753 aa  988    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  46.07 
 
 		 756 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  45.32 
 
 		 756 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  48.07 
 
 		 771 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  48.05 
 
 		 771 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  59.33 
 
 		 754 aa  872    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0420  malic enzyme  49.53 
 
 		 750 aa  667    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  57.89 
 
 		 758 aa  884    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  61.18 
 
 		 754 aa  932    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  77.57 
 
 		 764 aa  1208    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  45.92 
 
 		 761 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  63.52 
 
 		 762 aa  972    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  45.11 
 
 		 779 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  59.97 
 
 		 752 aa  927    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  100 
 
 		 761 aa  1547    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  45.08 
 
 		 760 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  46.54 
 
 		 759 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  45.81 
 
 		 759 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  72.39 
 
 		 440 aa  651    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  63.22 
 
 		 753 aa  904    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  46.68 
 
 		 759 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  72.18 
 
 		 754 aa  1086    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  51.28 
 
 		 780 aa  738    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  45.9 
 
 		 773 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  46.34 
 
 		 759 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  49.87 
 
 		 749 aa  697    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  59.97 
 
 		 751 aa  908    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  62.84 
 
 		 754 aa  909    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  46.34 
 
 		 759 aa  658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  46.07 
 
 		 756 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  46.54 
 
 		 759 aa  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  82.01 
 
 		 761 aa  1268    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  46.67 
 
 		 757 aa  664    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  45.53 
 
 		 755 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  48.39 
 
 		 771 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  44.89 
 
 		 776 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  60 
 
 		 758 aa  893    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  66.05 
 
 		 761 aa  986    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  46.02 
 
 		 756 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  48.99 
 
 		 749 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  46.68 
 
 		 759 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  46.6 
 
 		 763 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  46.07 
 
 		 756 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  46.34 
 
 		 759 aa  659    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  48.59 
 
 		 758 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  47.92 
 
 		 757 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  46.74 
 
 		 759 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>