141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0028 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  606  1e-172  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47407e-05 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  74.11 
 
 
291 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  72.07 
 
 
291 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  68.94 
 
 
291 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  59.54 
 
 
281 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  55.21 
 
 
292 aa  327  2e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  58.78 
 
 
297 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  58.4 
 
 
297 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  55.36 
 
 
332 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  57.09 
 
 
332 aa  305  5e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  55 
 
 
332 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  52.77 
 
 
316 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  55.43 
 
 
384 aa  292  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  54.65 
 
 
332 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  56.72 
 
 
341 aa  288  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  50.9 
 
 
337 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  55.02 
 
 
330 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  50.9 
 
 
337 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  53.18 
 
 
315 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  55.47 
 
 
332 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  48.8 
 
 
321 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  47.01 
 
 
305 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  45.61 
 
 
304 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.63 
 
 
266 aa  220  2e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  44.44 
 
 
281 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  45.24 
 
 
265 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  44.84 
 
 
270 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.57 
 
 
261 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  44.22 
 
 
261 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.82 
 
 
261 aa  180  3e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.96 
 
 
253 aa  166  6e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4506  hypothetical protein  38.1 
 
 
259 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.58 
 
 
258 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.31 
 
 
258 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.84 
 
 
249 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  36.07 
 
 
278 aa  133  4e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  36.22 
 
 
271 aa  130  4e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.4 
 
 
250 aa  129  5e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.76 
 
 
270 aa  129  7e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  35.6 
 
 
255 aa  129  7e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  34.28 
 
 
277 aa  129  8e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  32.94 
 
 
258 aa  128  1e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  34.39 
 
 
277 aa  128  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  34.88 
 
 
256 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  35.97 
 
 
270 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.83 
 
 
281 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  33.45 
 
 
307 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  34.51 
 
 
258 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.25 
 
 
283 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  34.78 
 
 
271 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  35.25 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  35.25 
 
 
268 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  35.25 
 
 
268 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.63 
 
 
265 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.63 
 
 
268 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  34.69 
 
 
268 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  35.43 
 
 
285 aa  121  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  35.63 
 
 
250 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  35.63 
 
 
250 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  35.63 
 
 
250 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  34.24 
 
 
268 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  35.63 
 
 
301 aa  119  4e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  35.63 
 
 
272 aa  120  4e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  35.63 
 
 
272 aa  120  4e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  35.63 
 
 
272 aa  120  4e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  35.22 
 
 
338 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.37 
 
 
283 aa  118  1e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  34.78 
 
 
320 aa  113  4e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  32.95 
 
 
279 aa  112  8e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  32.42 
 
 
282 aa  110  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  32.5 
 
 
286 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.59 
 
 
294 aa  110  4e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  34.1 
 
 
253 aa  108  7e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.98 
 
 
278 aa  108  8e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  29.3 
 
 
280 aa  108  9e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  30.98 
 
 
278 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  31.35 
 
 
277 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  30.94 
 
 
258 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  30.94 
 
 
258 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  34.69 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  34.92 
 
 
249 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  30.89 
 
 
251 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  32.78 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.92 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  32.37 
 
 
251 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  31.76 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  31.76 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  31.44 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1707  putative acyl-CoA N-acyltransferases (Nat) superfamily protein  31.69 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189579  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  29.59 
 
 
267 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  96.3  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  31.02 
 
 
251 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  33.21 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.64 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.64 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.64 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>