118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0023 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.05 
 
 
156 aa  199  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.33 
 
 
151 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.86 
 
 
151 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.9 
 
 
148 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  58.22 
 
 
148 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.57 
 
 
213 aa  174  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.86 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.14 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.46 
 
 
151 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.33 
 
 
155 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.64 
 
 
153 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  55 
 
 
150 aa  164  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.17 
 
 
154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  55 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.42 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.55 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
148 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.52 
 
 
216 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55 
 
 
147 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.38 
 
 
154 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.57 
 
 
158 aa  156  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.57 
 
 
158 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.76 
 
 
155 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  50.68 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.22 
 
 
187 aa  140  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.81 
 
 
197 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.9 
 
 
243 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  48.67 
 
 
176 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.36 
 
 
202 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.67 
 
 
176 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.33 
 
 
178 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.71 
 
 
204 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.48 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  43.97 
 
 
232 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.44 
 
 
246 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  43.26 
 
 
213 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.54 
 
 
193 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.4 
 
 
208 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.35 
 
 
151 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.14 
 
 
224 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.14 
 
 
224 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.22 
 
 
269 aa  113  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  51.68 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.41 
 
 
181 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.56 
 
 
241 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.3 
 
 
249 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.77 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40 
 
 
983 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  36.09 
 
 
997 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  34.68 
 
 
1012 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.21 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.85 
 
 
1011 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.85 
 
 
1011 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  31.97 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.62 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.81 
 
 
987 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.58 
 
 
220 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.93 
 
 
980 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.57 
 
 
1012 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.01 
 
 
1019 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.83 
 
 
991 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.43 
 
 
988 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.99 
 
 
222 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.71 
 
 
237 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.07 
 
 
204 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.36 
 
 
208 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.85 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.82 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.59 
 
 
988 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2028  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.17 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.19 
 
 
254 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.34 
 
 
248 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.74 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.53 
 
 
253 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.33 
 
 
150 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
216 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  26.39 
 
 
1027 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.95 
 
 
251 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
208 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.5 
 
 
232 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.58 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  31.91 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  27.54 
 
 
242 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.78 
 
 
241 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  29.41 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.03 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.36 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>