More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4042 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  55.14 
 
 		 900 aa  983    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 890 aa  1815    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  74.35 
 
 		 898 aa  1318    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  55.85 
 
 		 903 aa  1014    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  46.8 
 
 		 871 aa  768    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.82 
 
 		 658 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.73 
 
 		 590 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.19 
 
 		 279 aa  123  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 		 417 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 		 267 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.75 
 
 		 373 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 256 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.72 
 
 		 287 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 428 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 		 465 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 281 aa  108  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 405 aa  107  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 292 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 		 522 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 261 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 229 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.85 
 
 		 442 aa  104  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 355 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 		 477 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.1 
 
 		 251 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 372 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 291 aa  102  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 244 aa  101  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 213 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 213 aa  100  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 213 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 352 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 229 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 258 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 273 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 387 aa  99.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.31 
 
 		 244 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 273 aa  99.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 308 aa  100  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 542 aa  100  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 324 aa  99.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 255 aa  100  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  28.27 
 
 		 211 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.67 
 
 		 927 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.84 
 
 		 1115 aa  99.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.84 
 
 		 1119 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 		 1115 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 241 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 299 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 320 aa  98.6  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  33 
 
 		 273 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 273 aa  98.2  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 439 aa  98.2  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 310 aa  98.2  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 503 aa  98.2  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 321 aa  97.8  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 220 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 273 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 217 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 273 aa  97.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 273 aa  97.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 273 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 213 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 273 aa  97.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 522 aa  97.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 241 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 273 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.34 
 
 		 1115 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.34 
 
 		 1115 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 273 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 283 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 240 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 345 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.18 
 
 		 872 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 520 aa  95.5  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 269 aa  95.5  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 273 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 281 aa  94.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 245 aa  94.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 242 aa  94.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 275 aa  93.6  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 413 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 274 aa  92.8  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.63 
 
 		 241 aa  92.8  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 294 aa  92.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 221 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.21 
 
 		 350 aa  92.8  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 311 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  24.7 
 
 		 373 aa  92.4  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 264 aa  92  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 393 aa  92  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  33.5 
 
 		 275 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 272 aa  91.3  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 301 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.63 
 
 		 241 aa  90.9  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 204 aa  90.9  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  33.66 
 
 		 254 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 372 aa  90.5  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>