More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4028 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  54.23 
 
 
203 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  50.25 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  50.74 
 
 
204 aa  195  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  47.52 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  47.29 
 
 
255 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  45.59 
 
 
204 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  47.32 
 
 
203 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.59 
 
 
204 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  47.29 
 
 
205 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  47.78 
 
 
204 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  47.29 
 
 
204 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  47.09 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 
208 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.08 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  41.67 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  41.23 
 
 
219 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  41.4 
 
 
219 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  41.4 
 
 
219 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  39.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  39.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  39.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  39.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  39.22 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  40.93 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  39.22 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  39.22 
 
 
212 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  41.67 
 
 
212 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  41.18 
 
 
212 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  41.18 
 
 
212 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  41.18 
 
 
212 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  41.18 
 
 
212 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
221 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  40.64 
 
 
223 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  40.31 
 
 
220 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  41.62 
 
 
219 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  36.32 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  36.32 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  39.8 
 
 
222 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  35.38 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  38.79 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  39.19 
 
 
223 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  38.79 
 
 
216 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  33.82 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  37.1 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  35.89 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.28 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  37.14 
 
 
216 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 
218 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  38.57 
 
 
218 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  34.1 
 
 
222 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  38.46 
 
 
211 aa  121  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.45 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  34.74 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  34.78 
 
 
225 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.26 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
210 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
208 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
226 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
217 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 
209 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.56 
 
 
215 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 
205 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  27.49 
 
 
213 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.9 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 
211 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.43 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  27.83 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.56 
 
 
218 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
218 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  29.56 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  32.29 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.85 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.93 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.73 
 
 
208 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.27 
 
 
206 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
206 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.31 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>