More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4016 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  521  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03211  ABC transporter ATP-binding protein  87.6 
 
 		 264 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1748  ABC transporter related  78.4 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1816  toluene tolerance protein  78 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  51.79 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  51.18 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  50.39 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  54.66 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50 
 
 		 269 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  50.98 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  49.61 
 
 		 269 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 275 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  53.01 
 
 		 279 aa  255  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  50.2 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  50.58 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  52.78 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.98 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  52.78 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 		 279 aa  251  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  51.95 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  50.2 
 
 		 286 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  49.81 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.17 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  48.81 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  51 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  47.58 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  48.26 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  52.96 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  50.2 
 
 		 309 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  50.59 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  50.2 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  51.01 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  46.51 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  49.8 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  49.4 
 
 		 265 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  46.48 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  52.56 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  49.22 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  47.24 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  48.03 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  48.03 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  48.43 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  47.39 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  47.39 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  47.39 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  47.39 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  47.18 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  45.7 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  46.59 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50 
 
 		 270 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  46.59 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50.39 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  48.16 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  51.82 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  46.99 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  46.99 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  48.19 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  47.45 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.64 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.43 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.64 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.64 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  49.8 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  52.61 
 
 		 269 aa  225  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  51.81 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  48.03 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  46.85 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  46.85 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  46.85 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  47.64 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  48.03 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.46 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  47.24 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  47.67 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  47.24 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  49.21 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>