192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3959 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  54.61 
 
 
598 aa  636    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  59.21 
 
 
621 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
590 aa  1212    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  54.73 
 
 
593 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  46.05 
 
 
603 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  46.08 
 
 
603 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  46.39 
 
 
603 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  45.85 
 
 
603 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  45.73 
 
 
601 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  47.5 
 
 
619 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  44.44 
 
 
601 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  44.78 
 
 
601 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  45.53 
 
 
591 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  44.44 
 
 
601 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  44.92 
 
 
603 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  44.56 
 
 
602 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  45.5 
 
 
599 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  45.65 
 
 
599 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  47.39 
 
 
595 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  45.28 
 
 
594 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  49.23 
 
 
588 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  44.5 
 
 
583 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  43.94 
 
 
599 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  45.91 
 
 
587 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  45.83 
 
 
589 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  44.65 
 
 
613 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.77 
 
 
1283 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  43.23 
 
 
584 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  39.21 
 
 
586 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  36.87 
 
 
609 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  37.21 
 
 
609 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  36.69 
 
 
609 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  36.24 
 
 
619 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  36.69 
 
 
609 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.93 
 
 
611 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  37.16 
 
 
611 aa  353  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.07 
 
 
609 aa  353  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  35.1 
 
 
609 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.31 
 
 
609 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  36.61 
 
 
609 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  36.26 
 
 
609 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  36.76 
 
 
616 aa  350  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  36.17 
 
 
607 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.31 
 
 
616 aa  342  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  35.65 
 
 
609 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  37.16 
 
 
629 aa  339  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.04 
 
 
585 aa  339  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.54 
 
 
611 aa  339  9e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.59 
 
 
610 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  36.47 
 
 
610 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  38.73 
 
 
621 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 
615 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  33.28 
 
 
615 aa  323  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.17 
 
 
615 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.26 
 
 
592 aa  323  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  31.91 
 
 
637 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  33.17 
 
 
615 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  33.05 
 
 
589 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  32.63 
 
 
616 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  36.83 
 
 
635 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  32.36 
 
 
616 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  32.52 
 
 
616 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  34.88 
 
 
614 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  32.36 
 
 
616 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  33.27 
 
 
628 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  32.96 
 
 
617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  36.88 
 
 
628 aa  306  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  36.36 
 
 
618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.9 
 
 
602 aa  303  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  33.58 
 
 
624 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.87 
 
 
605 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  36.19 
 
 
608 aa  296  9e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  36.95 
 
 
610 aa  296  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  35.12 
 
 
593 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.77 
 
 
617 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  35.2 
 
 
605 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  34.2 
 
 
625 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  36.19 
 
 
608 aa  294  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  31.81 
 
 
646 aa  293  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.89 
 
 
625 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  31.49 
 
 
627 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  33.84 
 
 
613 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  34.46 
 
 
593 aa  286  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  36.34 
 
 
566 aa  283  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.6 
 
 
614 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.62 
 
 
607 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.62 
 
 
607 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  34.87 
 
 
629 aa  280  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.62 
 
 
607 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.66 
 
 
614 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  34.48 
 
 
618 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.72 
 
 
608 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.48 
 
 
614 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.57 
 
 
635 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  36.48 
 
 
611 aa  277  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  34.12 
 
 
617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  33.21 
 
 
635 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.71 
 
 
613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.21 
 
 
635 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  36.88 
 
 
614 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>