128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3815 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
384 aa  769    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  43.6 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  39.84 
 
 
377 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  43.78 
 
 
387 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  41.12 
 
 
384 aa  272  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  38.8 
 
 
386 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  38.54 
 
 
386 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  40.37 
 
 
388 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  38.8 
 
 
386 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  36.87 
 
 
390 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  36.1 
 
 
395 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  36.48 
 
 
390 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  36.36 
 
 
395 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  42.7 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  41.92 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  42.9 
 
 
384 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  42.9 
 
 
384 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  42.9 
 
 
384 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  42.9 
 
 
384 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  42.9 
 
 
384 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  42.9 
 
 
384 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  42.43 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  42.09 
 
 
384 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  36.63 
 
 
384 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  38.89 
 
 
388 aa  250  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  36.12 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  37.93 
 
 
388 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  39.68 
 
 
388 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  39.68 
 
 
388 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  36.98 
 
 
384 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  38.36 
 
 
388 aa  226  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  33.88 
 
 
400 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.32 
 
 
354 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  29.82 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  21.81 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  20.8 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  25.54 
 
 
329 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  20.23 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  27.5 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  22.96 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2686  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  29.23 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0104  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
609 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521795  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1699  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.01 
 
 
631 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.339077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.18 
 
 
611 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4553  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.16 
 
 
608 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.31 
 
 
613 aa  53.1  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18161  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.76 
 
 
631 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0522566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5182  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.57 
 
 
369 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.24 
 
 
615 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0480  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.4 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.117855  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16620  predicted phosphosugar isomerase  27.89 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.816556  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0270  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.55 
 
 
609 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.55 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.55 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2017  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.09 
 
 
603 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.851837  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2883  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.44 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2580  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.31 
 
 
610 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.49 
 
 
631 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.27 
 
 
609 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  24.19 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2741  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.44 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553109  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0562  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  30.88 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.149002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.37 
 
 
603 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0810967  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0208  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.73 
 
 
609 aa  47.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0172875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1164  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.37 
 
 
603 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402042  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.91 
 
 
609 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.91 
 
 
609 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0121  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.9 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.93 
 
 
611 aa  47  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0294  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  30.54 
 
 
335 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6153  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.66 
 
 
335 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311878  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.91 
 
 
607 aa  46.2  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04700  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  25.72 
 
 
607 aa  46.2  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4154  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase(isomerizing)  30.85 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4695  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.69 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2118  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase  26.4 
 
 
605 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4326  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.69 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4843  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  31.88 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2210  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.87 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0126466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2823  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.87 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.37 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.78 
 
 
606 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4351  sugar isomerase (SIS)  30.23 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1005  sugar isomerase (SIS)  26.2 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.29 
 
 
607 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0288  sugar isomerase (SIS)  26.05 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.97 
 
 
612 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000269055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1013  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase isomerizing  26.89 
 
 
616 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.75 
 
 
609 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.72 
 
 
609 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.91 
 
 
609 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>