More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3772 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  217  4e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03655  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
124 aa  188  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.949365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  183  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  77.68 
 
 
112 aa  178  3e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  177  3e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.56099e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
121 aa  177  5e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 
112 aa  177  5e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
114 aa  174  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  172  1e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  1e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  172  1e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  75.89 
 
 
112 aa  172  2e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  172  2e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  171  2e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  172  2e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  74.11 
 
 
112 aa  172  2e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  2e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  171  3e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  3e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  171  4e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  170  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  170  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.93377e-06  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 
112 aa  170  6e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  72.32 
 
 
112 aa  170  6e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  72.32 
 
 
112 aa  170  6e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 
112 aa  170  6e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 
112 aa  170  6e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  170  7e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  169  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  168  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  168  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  168  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  3.17831e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  168  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  168  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  167  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  168  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  168  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  73.21 
 
 
112 aa  167  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 
112 aa  167  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  73.21 
 
 
114 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  167  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  167  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 
112 aa  167  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  167  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
136 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  167  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  167  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
136 aa  166  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  166  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.21 
 
 
112 aa  166  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>