More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3706 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 738 aa  1447    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  53.99 
 
 		 727 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 1240 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 705 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 921 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.02 
 
 		 1499 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.14 
 
 		 1014 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  39.52 
 
 		 1177 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1202 aa  346  8.999999999999999e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 833 aa  339  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 758 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1310 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1622 aa  327  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.72 
 
 		 1767 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1767 aa  327  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.74 
 
 		 1765 aa  326  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1363 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 977 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 721 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 929 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1480 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1767 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  37.06 
 
 		 750 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 990 aa  319  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.64 
 
 		 929 aa  319  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1266 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1305 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1397 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1771 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.32 
 
 		 1763 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1768 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 991 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 816 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 876 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1398 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 925 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 950 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  36.62 
 
 		 931 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1267 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 1333 aa  308  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  38.35 
 
 		 914 aa  306  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.77 
 
 		 852 aa  306  9.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.63 
 
 		 1135 aa  306  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  38.22 
 
 		 1200 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1784 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 1193 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1236 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1303 aa  304  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  33.57 
 
 		 1064 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  40.4 
 
 		 977 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1786 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1230 aa  303  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  35.19 
 
 		 833 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 948 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.48 
 
 		 933 aa  300  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.19 
 
 		 937 aa  299  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1245 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.19 
 
 		 1322 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.45 
 
 		 932 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 936 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.47 
 
 		 765 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1165 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.75 
 
 		 1233 aa  298  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1326 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  33.94 
 
 		 1021 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1057 aa  296  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 985 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 		 782 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1765 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 1316 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1234 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.95 
 
 		 941 aa  295  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 801 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  39.46 
 
 		 918 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.4 
 
 		 1179 aa  293  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.42 
 
 		 932 aa  293  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1287 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 		 1236 aa  293  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 1238 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1238 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1238 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1166 aa  290  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1238 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 956 aa  290  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  36.71 
 
 		 905 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.21 
 
 		 932 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.21 
 
 		 933 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  33.48 
 
 		 1214 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  37.7 
 
 		 785 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.64 
 
 		 937 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 1236 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 1236 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  40.47 
 
 		 918 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.21 
 
 		 933 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 916 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1172 aa  287  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.42 
 
 		 1053 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  37.57 
 
 		 785 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1255 aa  286  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  35.95 
 
 		 891 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>