More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3692 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
685 aa  1395    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 
742 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 
738 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 
707 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 
707 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 
707 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 
715 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
727 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  35.7 
 
 
727 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 
706 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 
726 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
728 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 
751 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
743 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
722 aa  221  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
743 aa  220  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
743 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
743 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.78 
 
 
705 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
743 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 
702 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 
743 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
702 aa  217  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
811 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 
811 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 
774 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 
716 aa  207  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 
758 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 
756 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  27.61 
 
 
744 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
753 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
742 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 
728 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 
729 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 
728 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 
728 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 
712 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 
708 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
710 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 
712 aa  193  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 
719 aa  190  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
710 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 
727 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 
809 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 
722 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 
805 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 
729 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.76 
 
 
704 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.16 
 
 
804 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
724 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 
731 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.06 
 
 
804 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 
819 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.33 
 
 
724 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 
762 aa  179  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 
725 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
761 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
801 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 
802 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 
768 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
772 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 
800 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 
764 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 
729 aa  174  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 
801 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
730 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.71 
 
 
737 aa  173  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 
777 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 
761 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 
753 aa  170  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 
718 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 
729 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 
730 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  26.25 
 
 
771 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 
764 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 
755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 
734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 
808 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 
708 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 
757 aa  163  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 
768 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
729 aa  162  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  25.15 
 
 
763 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  24.89 
 
 
720 aa  161  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 
746 aa  160  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 
750 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 
770 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 
772 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 
772 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 
701 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 
823 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 
804 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 
710 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 
718 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 
706 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 
726 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  26.19 
 
 
742 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
712 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>