167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3667 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  51.24 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  33.62 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  33.91 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  28.1 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  28.1 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  33.94 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  29.23 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  26.36 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  31.3 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  31.03 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  39.09 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  34.21 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  33.96 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  31.15 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  29.91 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  31.9 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  29.06 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  44.29 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  33.65 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.19 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  40.7 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  32.33 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  28.24 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  27.93 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  28.83 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  27.03 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  36.26 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  44.16 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  44.16 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  36.26 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  31.09 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  41.79 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  40.91 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  27.78 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  45.71 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  20.91 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  42.42 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  42.86 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  20.91 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  43.94 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0317  CopY family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  hitchhiker  0.0079489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  43.94 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  19.44 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  26.73 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  25.21 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  22.22 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  25.69 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  22.88 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  29.66 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  35.23 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  39.39 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  35.63 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>