100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3590 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  40.18 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  45.45 
 
 		 145 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  42.95 
 
 		 187 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  42.66 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  44.37 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  37.93 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  36.36 
 
 		 170 aa  102  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  42.66 
 
 		 185 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  34.23 
 
 		 186 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  40.85 
 
 		 140 aa  93.2  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  38.13 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  55.36 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  28.24 
 
 		 202 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  31.13 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30.92 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  29.63 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  30.56 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  32.87 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  31.61 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  47.06 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  31.45 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.48 
 
 		 133 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 		 536 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  47.06 
 
 		 605 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  39.36 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  31.68 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  30.97 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3454  MJ0042 family finger-like protein  47.06 
 
 		 588 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.052839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  47.06 
 
 		 610 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  36.27 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  38 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  34.01 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  46.97 
 
 		 77 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  39.53 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  39.53 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  39.53 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  38.46 
 
 		 176 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  39.53 
 
 		 449 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  39.53 
 
 		 448 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  34.62 
 
 		 376 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  34.34 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  39.53 
 
 		 444 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  30.13 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  46 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  40.38 
 
 		 727 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  25.42 
 
 		 163 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  25.45 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.72 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  26.74 
 
 		 196 aa  50.4  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  25.71 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  28.92 
 
 		 447 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  20.54 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  36.67 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  47.73 
 
 		 409 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  32.45 
 
 		 180 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  19.39 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  29.73 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  26.37 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  36.36 
 
 		 138 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  37.18 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4468  MJ0042 family finger-like protein  34.04 
 
 		 590 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  29.73 
 
 		 668 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  34.91 
 
 		 453 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.53 
 
 		 154 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  29.73 
 
 		 157 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.78 
 
 		 167 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  29.03 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  28.44 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  26.95 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  31.32 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  28.86 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  34.62 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  30.23 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  26.89 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  35.05 
 
 		 403 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  35.56 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  25.82 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  26.94 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  35.53 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3995  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00690793  normal  0.10342 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  22.94 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0296  hypothetical protein  34.78 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542313  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3438  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  29.55 
 
 		 634 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  25.9 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0077  hypothetical protein  40.48 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  34.12 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2240  RDD domain containing protein  35.14 
 
 		 194 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  30.26 
 
 		 169 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  27.38 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  24.16 
 
 		 162 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>