More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3587 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
375 aa  733    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  53.62 
 
 
381 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  53.35 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  56.87 
 
 
311 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  52.92 
 
 
375 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 
388 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  48.82 
 
 
379 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 
377 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  48.9 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  43.65 
 
 
365 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  43.65 
 
 
365 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  47.8 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.67 
 
 
336 aa  245  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  45.09 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  45.92 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  43.7 
 
 
421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  44.28 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  44.59 
 
 
379 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.83 
 
 
377 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.18 
 
 
364 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  43.89 
 
 
366 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  43.36 
 
 
320 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.53 
 
 
374 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  40.52 
 
 
308 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  42.41 
 
 
338 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  43.02 
 
 
365 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  42.42 
 
 
386 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 
386 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.92 
 
 
368 aa  222  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  36.55 
 
 
405 aa  222  9e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  45.76 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.51 
 
 
475 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  48.5 
 
 
365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  40.88 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 
352 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 
379 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  44.51 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.44 
 
 
358 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.21 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.24 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.24 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 
338 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 
338 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.24 
 
 
338 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 
338 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  44.29 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  38.39 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.29 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.4 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.48 
 
 
369 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  39.08 
 
 
362 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 
340 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.63 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  42.74 
 
 
394 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  36.17 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.02 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  39.56 
 
 
338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  36.55 
 
 
407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.8 
 
 
383 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  50.81 
 
 
362 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.29 
 
 
375 aa  212  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  48.5 
 
 
365 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  41.87 
 
 
372 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  45.31 
 
 
362 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  38.02 
 
 
369 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  38.12 
 
 
361 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  42.9 
 
 
422 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  42.9 
 
 
368 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  45.13 
 
 
379 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 
408 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  39.05 
 
 
338 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 
369 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  42.57 
 
 
365 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.81 
 
 
361 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  40.99 
 
 
405 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  37.66 
 
 
409 aa  205  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  44.86 
 
 
366 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  39.33 
 
 
369 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.46 
 
 
365 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  40.12 
 
 
373 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 
382 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  38.37 
 
 
373 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  47 
 
 
387 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  43.35 
 
 
401 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 
377 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  44.95 
 
 
434 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  38.99 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  43.49 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  44.95 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  43.01 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  43.08 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.76 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.67 
 
 
377 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  33.66 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  41.58 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>