116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3562 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
139 aa  276  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  45.16 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.97 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.15 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  41.32 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.35 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.63 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.48 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.9 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.48 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.17 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.24 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  44.32 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.7 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.21 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.04 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.48 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  34.21 
 
 
247 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  34.26 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.26 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.26 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.48 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  33.61 
 
 
112 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.16 
 
 
117 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.09 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.83 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.45 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.62 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0787  DNA-binding protein H-NS  31.62 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.123185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.35 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2540  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.48 
 
 
135 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000233995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  49.23 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  36.59 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  44.9 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  32.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.75 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.3 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.62 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.18 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.18 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5567  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.97 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000568054  normal  0.0551965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.59 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.9 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.59 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  39.76 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.95 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7449  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.31 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.71 
 
 
99 aa  43.5  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.57 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  36.9 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.41 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5671  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6035  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.64 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  35.35 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6525  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.75 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  30.43 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.09 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.7 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  36.36 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  36.36 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  36.36 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  36.36 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  36.36 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  36.36 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.1 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.84 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.24 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.57 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.9 
 
 
103 aa  40.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.72 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  27.47 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  38.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  34.83 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  38.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  38.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.43 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  38.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  38.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  38.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>