More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3558 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 297 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  48.58 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  48.58 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  48.23 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  47.47 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  47.44 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  47.87 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  47.1 
 
 		 296 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  43.18 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  41.49 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  42.91 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  43.97 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  37.04 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  42.91 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  36.24 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  40.28 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  36.88 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  38.81 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  38.85 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  39.58 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  38.81 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  38.41 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  38.41 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  37.41 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  39.3 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  39.72 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  38.95 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  38.83 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  38.52 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  39.22 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  39.22 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  34.38 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  33.45 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  31.99 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  31.73 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  32.07 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.83 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.97 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  31.76 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  33.21 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  33.68 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 333 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.67 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.58 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  32.88 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  33.11 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.75 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.49 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.5 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  32.44 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.29 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  32.82 
 
 		 312 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  30.14 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  30.8 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  31.44 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.08 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.58 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.83 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.83 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.38 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.87 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.83 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.08 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.71 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.35 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.35 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.35 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  29.37 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  26.35 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  33.58 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.78 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>