166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3523 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3523  OmpW family protein  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.11983  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03097  outer membrane protein  65.5 
 
 
228 aa  296  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1909  OmpW family protein  49.09 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000171006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1977  outer membrane protein  48.64 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.000000000000671005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.96 
 
 
210 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  36.94 
 
 
209 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  33.33 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  32.12 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  32.56 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  30.59 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  30.59 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  30.59 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  35.4 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  36.36 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  31.31 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  28.77 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  33.33 
 
 
211 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  32.68 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  28.64 
 
 
211 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  37.27 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  29.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  29.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  29.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  29.91 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  34.21 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  30.72 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  32.45 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  31.48 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  32.41 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  32.79 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  28.76 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  27.78 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  27.78 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  29.15 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  30.46 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  30.04 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  33.12 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  27.52 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  30.04 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  29.46 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  36.43 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  32.24 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  29.46 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  36.43 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  29.46 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  29.15 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  29.15 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  34.69 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  29.41 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  29.41 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  29.41 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  36.05 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  29.05 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  29.85 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  30.95 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.65 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  30.06 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.98 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  29.68 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  33.33 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  31.74 
 
 
267 aa  79  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  32.89 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  27.4 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  28.64 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  27.85 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  28.65 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  34.29 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  31.71 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  31.48 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  29.41 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  29.41 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  29.85 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  27.57 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.23 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  29.25 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  27.57 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  32.03 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  30.84 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  27.44 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  32.1 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  28.57 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  28.57 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  25.96 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  26.98 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  26.98 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  26.98 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  26.98 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  29.09 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  26.98 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  32.65 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  30.72 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  30.72 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  31.17 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  32.03 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  30 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  30 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  30 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  29.86 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  30 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>