More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3520 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.26 
 
 		 579 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.87 
 
 		 685 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1944  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.69 
 
 		 593 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0868874  hitchhiker  0.000336212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1603  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.51 
 
 		 594 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00100727  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.93 
 
 		 680 aa  668    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  61.13 
 
 		 589 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 602 aa  1201    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.47 
 
 		 590 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.2 
 
 		 593 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00163952  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  61.13 
 
 		 589 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5336  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.43 
 
 		 590 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.43 
 
 		 591 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2096  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.9 
 
 		 616 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.96 
 
 		 589 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.95 
 
 		 619 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.59 
 
 		 603 aa  909    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.96 
 
 		 588 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.15 
 
 		 594 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.68 
 
 		 626 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  61.13 
 
 		 589 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.88 
 
 		 600 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.8 
 
 		 589 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  61.13 
 
 		 589 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.5 
 
 		 588 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.46 
 
 		 603 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2165  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.63 
 
 		 610 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.327793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.8 
 
 		 592 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.8 
 
 		 589 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.36 
 
 		 594 aa  654    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.17 
 
 		 607 aa  1024    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.4 
 
 		 595 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.8 
 
 		 588 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.41 
 
 		 599 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1784  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.42 
 
 		 621 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1966  dihydrolipoyl dehydrogenase  60.93 
 
 		 580 aa  663    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258169  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.63 
 
 		 588 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.23 
 
 		 592 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.63 
 
 		 589 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.31 
 
 		 607 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.459857 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.42 
 
 		 603 aa  910    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  61.13 
 
 		 589 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.8 
 
 		 588 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.4 
 
 		 595 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1306  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.61 
 
 		 593 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1086  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.1 
 
 		 587 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0812203  normal  0.813461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.91 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2214  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.35 
 
 		 619 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.630644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.59 
 
 		 605 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2126  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.52 
 
 		 595 aa  628  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2669  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.75 
 
 		 614 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1199  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.69 
 
 		 592 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000025561  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1659  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.93 
 
 		 619 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.45 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.92 
 
 		 625 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.43 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2123  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.05 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2464  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.71 
 
 		 617 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.88 
 
 		 589 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1917  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.65 
 
 		 609 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3978  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.52 
 
 		 614 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198165  decreased coverage  0.00908444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 475 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 475 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 475 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 475 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.52 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.63 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.84 
 
 		 475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.97 
 
 		 476 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  60 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 474 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  60 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 475 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 474 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.79 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 474 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.42 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.58 
 
 		 475 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.08 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 474 aa  569  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 475 aa  571  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>