More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3481 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  49.57 
 
 
695 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  50.35 
 
 
697 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  56.93 
 
 
684 aa  795    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  52.15 
 
 
681 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  61.06 
 
 
711 aa  871    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  82.73 
 
 
697 aa  1190    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  52.94 
 
 
718 aa  739    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  58.82 
 
 
697 aa  842    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
698 aa  1438    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  52.65 
 
 
676 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  55.73 
 
 
696 aa  798    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  47.81 
 
 
710 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  51.74 
 
 
702 aa  685    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  51.69 
 
 
697 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  67.87 
 
 
695 aa  982    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  53.5 
 
 
663 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  59.17 
 
 
741 aa  817    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  51.55 
 
 
697 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  50.64 
 
 
697 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  50.64 
 
 
697 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  52.48 
 
 
697 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  51.63 
 
 
697 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  52.2 
 
 
696 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  53.5 
 
 
663 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  51.03 
 
 
676 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  51.39 
 
 
701 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  65.86 
 
 
711 aa  921    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  53.5 
 
 
663 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  56.48 
 
 
685 aa  782    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  51.55 
 
 
673 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  52.15 
 
 
681 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  51.69 
 
 
697 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.39 
 
 
770 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.15 
 
 
767 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  46.18 
 
 
722 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.05 
 
 
689 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.48 
 
 
691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  43.62 
 
 
793 aa  574  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.5 
 
 
712 aa  569  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.59 
 
 
696 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.01 
 
 
691 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  44.23 
 
 
734 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  41.53 
 
 
688 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  43.31 
 
 
699 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  41.39 
 
 
748 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  40.9 
 
 
732 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  41.51 
 
 
782 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.68 
 
 
721 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.68 
 
 
702 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.68 
 
 
721 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  40.9 
 
 
698 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  40.9 
 
 
772 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  41.51 
 
 
776 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  41.51 
 
 
776 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  40.9 
 
 
698 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.98 
 
 
707 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.69 
 
 
703 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  40.65 
 
 
694 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.72 
 
 
704 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.32 
 
 
721 aa  485  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  35.54 
 
 
680 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  34.84 
 
 
680 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  29.87 
 
 
685 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
719 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  30.31 
 
 
701 aa  247  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  28.67 
 
 
688 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
700 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  28.89 
 
 
1283 aa  239  9e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  30.35 
 
 
719 aa  239  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
703 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  28.74 
 
 
719 aa  230  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  28.91 
 
 
723 aa  230  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
688 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
688 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
689 aa  228  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  45.52 
 
 
704 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  37.67 
 
 
727 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  35.25 
 
 
703 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  37.67 
 
 
727 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  28.33 
 
 
685 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  39.07 
 
 
679 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  36.96 
 
 
727 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  36.96 
 
 
727 aa  223  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  37.13 
 
 
727 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  37.13 
 
 
727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  36.51 
 
 
727 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  39.07 
 
 
677 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  36.34 
 
 
729 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  36.68 
 
 
726 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  34.32 
 
 
707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 
718 aa  221  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
682 aa  220  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  29.79 
 
 
719 aa  220  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  41.06 
 
 
730 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  39.25 
 
 
708 aa  219  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  43.89 
 
 
724 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  34.87 
 
 
718 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  34.33 
 
 
689 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  34.36 
 
 
714 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  36.24 
 
 
696 aa  217  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>