More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3451 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  74.85 
 
 
687 aa  1013  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  78.38 
 
 
686 aa  1073  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  74.85 
 
 
687 aa  1013  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3451  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
691 aa  1401  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  45.4 
 
 
645 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  43.56 
 
 
636 aa  506  1e-142  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  46.25 
 
 
630 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  45.31 
 
 
611 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  45.78 
 
 
630 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 
637 aa  481  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  42.07 
 
 
618 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  1.09983e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  41.84 
 
 
627 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  41.33 
 
 
673 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  42.07 
 
 
618 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  42.07 
 
 
618 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.07443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  42.07 
 
 
618 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.42864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 
618 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 
618 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.94498e-05  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  41.22 
 
 
629 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  40.91 
 
 
629 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  41.2 
 
 
618 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 
618 aa  469  1e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.5861e-05  unclonable  1.00578e-10 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  41.05 
 
 
629 aa  470  1e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.22 
 
 
641 aa  471  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  43.07 
 
 
630 aa  469  1e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  43.69 
 
 
681 aa  471  1e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  41.05 
 
 
629 aa  471  1e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  40.73 
 
 
638 aa  471  1e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.6113e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 
618 aa  472  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.00115e-07  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.83 
 
 
618 aa  466  1e-130  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  41.49 
 
 
803 aa  468  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  41.16 
 
 
610 aa  466  1e-130  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  42.09 
 
 
801 aa  468  1e-130  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  41.79 
 
 
652 aa  467  1e-130  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  40.78 
 
 
631 aa  468  1e-130  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  41.18 
 
 
809 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  40.1 
 
 
618 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  41.24 
 
 
802 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  40.72 
 
 
793 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  41.24 
 
 
802 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
618 aa  465  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.24923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  42.2 
 
 
631 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  41.24 
 
 
802 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  43.89 
 
 
655 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  41.24 
 
 
802 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  41.18 
 
 
803 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  41.19 
 
 
646 aa  460  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  43.4 
 
 
667 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  40.81 
 
 
637 aa  461  1e-128  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  40.73 
 
 
802 aa  462  1e-128  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  41.57 
 
 
646 aa  460  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  41.2 
 
 
632 aa  462  1e-128  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  39.77 
 
 
631 aa  459  1e-128  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  42.51 
 
 
630 aa  462  1e-128  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  40.1 
 
 
631 aa  459  1e-128  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  41.87 
 
 
631 aa  461  1e-128  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  40.1 
 
 
631 aa  459  1e-128  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  42.09 
 
 
629 aa  460  1e-128  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  43.4 
 
 
631 aa  460  1e-128  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  40.92 
 
 
617 aa  459  1e-128  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  39.78 
 
 
630 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 
640 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  40.09 
 
 
766 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  40.75 
 
 
617 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  40.24 
 
 
650 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  40.98 
 
 
801 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  39.93 
 
 
631 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  42.7 
 
 
646 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 
618 aa  458  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.72636e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  42.05 
 
 
629 aa  455  1e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  40.66 
 
 
801 aa  454  1e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  40.65 
 
 
632 aa  452  1e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  40.13 
 
 
643 aa  453  1e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  39.1 
 
 
623 aa  452  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.81771e-08 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  40.36 
 
 
634 aa  454  1e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  40.74 
 
 
638 aa  455  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  39.1 
 
 
623 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.25085e-06 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
633 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  38.44 
 
 
641 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  39.44 
 
 
623 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  39.6 
 
 
623 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  39.44 
 
 
623 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  2.0031e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  41.29 
 
 
618 aa  452  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.90878e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  38.64 
 
 
634 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 
633 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  40.17 
 
 
610 aa  449  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  4.26063e-07 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 
633 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 
633 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 
633 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.20235e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  40.13 
 
 
703 aa  449  1e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 
633 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  42.66 
 
 
626 aa  447  1e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  39.16 
 
 
767 aa  446  1e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  38.62 
 
 
634 aa  448  1e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  39.91 
 
 
800 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  38.61 
 
 
633 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  38.81 
 
 
625 aa  445  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  38.61 
 
 
633 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.98209e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  38.61 
 
 
633 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  38.61 
 
 
633 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.10034e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>