169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3424 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  100 
 
 
429 aa  844    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  81.23 
 
 
407 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  75.25 
 
 
429 aa  618  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  75 
 
 
429 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  49.3 
 
 
438 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  54.5 
 
 
1140 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  47.51 
 
 
429 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  49.14 
 
 
419 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  44.63 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  41.2 
 
 
444 aa  322  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  41 
 
 
440 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  45.57 
 
 
408 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.94 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  46.31 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  43.22 
 
 
429 aa  312  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  42.4 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  41.95 
 
 
437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.24 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  43.67 
 
 
452 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  44.31 
 
 
413 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  43.35 
 
 
452 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  42.08 
 
 
426 aa  296  4e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  43.82 
 
 
452 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.21 
 
 
443 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 
432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 
432 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 
432 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  40.33 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 
432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  41.27 
 
 
435 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  40.24 
 
 
435 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  40.13 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  40.57 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  39.15 
 
 
431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  39.39 
 
 
432 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  38.3 
 
 
433 aa  272  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  37.84 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  39.76 
 
 
434 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  39.62 
 
 
418 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  35.27 
 
 
436 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
435 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  34.05 
 
 
427 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.96 
 
 
435 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 
424 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  34.62 
 
 
437 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  33.58 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  34.13 
 
 
407 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.83 
 
 
415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  35.48 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.58 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  32.63 
 
 
431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 
423 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.75 
 
 
423 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 
423 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 
423 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  34.33 
 
 
423 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  32.75 
 
 
423 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  34.43 
 
 
426 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  33.08 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  34.08 
 
 
423 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  34.92 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.08 
 
 
423 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  35.32 
 
 
421 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
428 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  32.19 
 
 
403 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.12 
 
 
431 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.45 
 
 
431 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.38 
 
 
410 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.87 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.11 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.12 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.32 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.99 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.45 
 
 
428 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  34.07 
 
 
431 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  30.42 
 
 
425 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.67 
 
 
417 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  34.66 
 
 
428 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.37 
 
 
435 aa  170  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.59 
 
 
417 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  31.6 
 
 
412 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  33.91 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  29.76 
 
 
458 aa  163  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  30.66 
 
 
405 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.37 
 
 
436 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  30.21 
 
 
471 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.24 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  31.84 
 
 
413 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  30.17 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  27.86 
 
 
425 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  29.93 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  27.93 
 
 
485 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  32.89 
 
 
433 aa  136  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  31.96 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  32.48 
 
 
434 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  29.11 
 
 
421 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  31.31 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  30.36 
 
 
457 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  29.54 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>