195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3405 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  66.17 
 
 
271 aa  329  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  56.13 
 
 
260 aa  318  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  54.65 
 
 
260 aa  309  4e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  51.58 
 
 
216 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  51.61 
 
 
216 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 
215 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  46.6 
 
 
215 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  41.12 
 
 
211 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 
210 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  39.72 
 
 
210 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  40.38 
 
 
210 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  42.77 
 
 
213 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.34 
 
 
211 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  44.64 
 
 
214 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.64 
 
 
214 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.8 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  40.53 
 
 
216 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.71 
 
 
216 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
210 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  41.92 
 
 
206 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.31 
 
 
214 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 
210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  38.04 
 
 
293 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
212 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
206 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  37.5 
 
 
206 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
215 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  38.8 
 
 
218 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  40.12 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  37.27 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
213 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  34.39 
 
 
214 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
213 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  32.98 
 
 
212 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  39.67 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
211 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  37.42 
 
 
215 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  38.59 
 
 
203 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
203 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.04 
 
 
204 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  32.68 
 
 
225 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
208 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
215 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  38.65 
 
 
218 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
212 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
212 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
212 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 
215 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.34 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  36.96 
 
 
203 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.73 
 
 
212 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  29 
 
 
220 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
221 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.58 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
220 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 
211 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 
205 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
233 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
202 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 
207 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.41 
 
 
202 aa  98.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  36.7 
 
 
203 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  38.04 
 
 
203 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 
203 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 
203 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 
202 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 
202 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 
202 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 
202 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
201 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  29.72 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.49 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  29.72 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 
223 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
218 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.34 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  27.81 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  28.88 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 
207 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.06 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>