More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3379 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 360 aa  711    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  60.46 
 
 		 354 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  59.55 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  58.24 
 
 		 353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  58.24 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  57.94 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  57.05 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  58.24 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  48.84 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  47.11 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  50.97 
 
 		 342 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  53.4 
 
 		 358 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  49.26 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  51.51 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  47.35 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  49.54 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  51.51 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.85 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  47.54 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  53.7 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  48.56 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  43.64 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  51.32 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  46.73 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 396 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  44.76 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  43.93 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.96 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.46 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  44.63 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  43.79 
 
 		 380 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 390 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.99 
 
 		 363 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  41.4 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.53 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 372 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  43.67 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40.24 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43.04 
 
 		 363 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.47 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  42.72 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.19 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  42.09 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  42.09 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.21 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 344 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  43.96 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  45.06 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  45.28 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  45.28 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  45.28 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.55 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 		 351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  42.69 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  45.27 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  43.02 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  40.49 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  39.82 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  36.13 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  36.13 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  40.25 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  41.55 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  41.55 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  41.55 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  35.73 
 
 		 467 aa  199  7e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.7 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.66 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  42.18 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.61 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>