More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3333 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  46.4 
 
 
250 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  46.67 
 
 
258 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  45.28 
 
 
258 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  43.2 
 
 
337 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
252 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  43.95 
 
 
268 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
252 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  42.13 
 
 
251 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
254 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.67 
 
 
251 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  41.11 
 
 
259 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  44 
 
 
262 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
260 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.22 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 
279 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.13 
 
 
253 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  32.81 
 
 
263 aa  125  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
263 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  29.23 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32.95 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
268 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
258 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
263 aa  92  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
263 aa  92  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
263 aa  92  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  23.48 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.92 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  34.65 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.83 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.04 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.84 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.24 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.8 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.7 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  34.02 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.68 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  33.04 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.05 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  38.74 
 
 
207 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.99 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.22 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.07 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.55 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.05 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.15 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  41.84 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.1 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.82 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.15 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
415 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  37.04 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  25.76 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
196 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  29.82 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  39.45 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  36.15 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.98 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.49 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
226 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  38.04 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.64 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.96 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
287 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.33 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  37.89 
 
 
312 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3810  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>